Helaas is de oorzaak van fibromyalgie nog steeds niet bekend. Wel zijn er een aantal artsen/wetenschappers die hierover een mening hebben en denken de oorzaak van de ziekte fibromyalgie te weten.

Hier een paar mogelijke oorzaken:

- Verzuring van de spieren.
- Verstoring van hormonale klieren waarbij de hersenen verkeerd worden aangestuurd.
- Een verstoorde balans van neurotransmitters in de herseninsula.
- Verkeerde signalen vanuit het zenuwstelsel.
- Overactief spiermembraan.
- Teveel zenuwvezels aan de bloedvaten.
- Te hoge bloedspiegel.
- Langdurige psychische stress of fysieke overbelasting.
- Een virale of bacteriële infectie.
- Darmproblemen.
- Vitamines tekort (voornamelijk D en B12)
- Erfelijkheid (dit is niet bewezen maar vaak hebben meerdere mensen het in de familie).
- Een trauma.
- Een stofwisselingsziekte.

Zoals u begrijpt is de medische wereld er nog niet over uit, wat de werkelijke oorzaak van fibromyalgie is. De ziekte is niet aantoonbaar door onderzoeken, in het bloed of op een scan is geen afwijking te zien en hierdoor is het voor een arts erg lastig om de diagnose fibromyalgie te stellen. Vaak wordt de diagnose vastgesteld door de symptomen die de patiënt heeft.